Eğitim Yöneticisi ve Öğretmen Yetiştirme Okul Komutanlığının görev alanına giren etkinlikler, ilk olarak 1972 yılında kurulan ve Hava Kuvvetleri Komutanlığının öğretmen yetiştirme merkezi olan "Öğretmen Yetiştirme Kursu Başöğretmenliği" adı altında başlatılmıştır. Daha sonra yeni bir teşkilatlanmaya gidilerek 1982 yılında "Özel Kurslar Okul Komutanlığı", 1986 yılında "İstihbarat ve Özel Kurslar Okul Komutanlığı" adını almıştır.

       Eğitim bilimleri alanında; özellikle de davranış bilimlerindeki gelişmelerin Hava Kuvvetleri eğitim sistemine kazandırılması ve dolayısıyla çağdaş eğitimin gerektirdiği nitelikte öğretmen ve eğitim yöneticisinin yetiştirilebilmesi amacıyla, eğitim/öğretim sisteminin bu alana yönelik özelliği de dikkate alınarak 01 Ağustos 1991 tarihinden itibaren "Eğitim Yöneticisi ve Öğretmen Yetiştirme Okul Komutanlığı" (EYÖYOK.K.lığı) olarak bugünkü yapısına kavuşmuştur.