Hv.K.K.’lığı bünyesinde “profesyonel anlamda güvenlik sistemi” kurma çalışmaları 1980’li yılların ortalarına rastlamaktadır. Bu yıllarda sadece araştırma ve inceleme faaliyetleri olarak sürdürülen çalışmalar, 1992 yılında üç hava piyade subayının ABD Güvenlik Akademisi’ne (Security Police Academy) güvenlik uzmanı ve eğiticisi yetiştirilmek üzere gönderilmesiyle hız kazanmıştır.

       1993 yılında hava güvenlik sisteminin teşkilatlanması kapsamında ilk olarak Hava Kuvvetleri Komutanlığı karargahında Güvenlik Şube Müdürlüğü kurulmuştur. Bu çalışmaları takiben aynı yıl içinde hava güvenlik sisteminin yönetici ve uygulayıcılarının yetiştirileceği, temel güvenlik eğitimlerinin verileceği Güvenlik Okul Komutanlığı’nın kuruluş çalışmaları başlatılmış ve çekirdek kadrosuyla Hava Meydan Kt.K.lığı-(Adnanmenderes)’nın mevcut bina ve tesislerinde kuruluş ve gerekli akademik çalışmalara başlamıştır. Bu çalışmalar sonucunda 8 Haziran 1993 tarihinde birinci dönem güvenlik uzman erbaşlarının eğitimine başlanmıştır.Güvenlik Okul Komutanlığının yeni binasının inşaatı Kasım 1994 tarihinde tamamlanmış, yeni ve modern binasında, yeterli sayıda dershaneleri, uygulamalı laboratuar, havalı silah poligonu, açık hava eğitim tesisleri, atış poligonları ve diğer sosyal kolaylıkları ile eğitimlerini sürdürmeye devam etmiştir.

       HAGOK K.lığı kuruluşunun ilk yıllarında sadece uzman erbaşlara eğitim verirken;1995 yılında piyade sınıfının “sınıf okulu” hüviyetini almasıyla, piyade subay ve astsubayların temel eğitimlerini vermeye başlamıştır. Bu gelişme ile hava kuvvetlerininihtiyacı olan piyade astsubay ve subayları K.K.K. lığı Tuzla Piyade Okulu yerine GÜV.OK. K.lığında eğitilmeye başlanmış ve böylece Güvenlik Okul Komutanlığı bugünkü yapısına kavuşmuştur.