1990 yılında icra edilen Hava Eğitim Komutanlığı Eğitim Semineri'nde, en küçük birlikten, üs seviyesine kadar her seviyedeki kıt'a ve karargah sevk ve usullerini harekat ve lojistik açıdan subaylara öğretecek; sevk ve idarede yetenek, bilgi ve becerileri onlara kazandıracak, kendi alanında araştırma ve geliştirme yapacak bir Harekat Lojistik okuluna gereksinim duyulduğu belirtilmiştir.

       Konu üzerinde Teknik Okullar Komutanlığı bünyesindeki tüm okul ve birimlerin ortak olumlu yaklaşımları ve böyle bir okula ihtiyaç duyulduğu konusundaki ortak görüşün ortaya çıkması üzerine, konu Hava Eğitim Komutanlığı tarafından gerekçeleri ile Hava Kuvvetleri Komutanlığına arz edilmiştir.

       Tüm bu gelişmeler ve istekler Hava Kuvvetleri Komutanlığına arz edilmiş ve yapılan değerlendirme sonucunda okulun üç aşamada kurulması yönünde 1990 yılı Temmuz ayında Komutanlık Direktifi yayımlanmıştır. Komutanlık direktifleri ve kuruluş çalışmaları sonucunda HİLYOK Komutanlığı 13 Mart 1991 tarihinde resmen eğitime açılmıştır.

       Hv.K.K.lığının son yıllarda yaşadığı yoğun modernizasyon ve kazandığı teknolojik kabiliyetler, özellikle harekat ve yönetim ağırlıklı eğitim ihtiyacını artırmıştır. Subay kaynağındaki çeşitliliğin artması ve uzaktan eğitim alanındaki gelişmeler, HİLYOK Komutanlığı ve eğitimlerinin yeniden yapılandırılması gereksinimini ortaya çıkarmıştır.

       Anılan ihtiyaçlar doğrultusunda Hv.Snf.Ok.K.lığı’nda yürütülen çalışmalar neticesinde faaliyetlerini ayrı komutanlıklar olarak yürütecek; Harekat Hazırlık ve Yönetim Okul Komutanlığı, Subay Yetiştirme Okul Komutanlığı ve Uzaktan Eğitim Merkezi Komutanlıklarının kuruluş kadro teklifleri 2004 yılında onay için komutanlığa gönderilmiştir. Kuruluş kadro teklifleri onaylanan komutanlıkların 01 Eylül 2005 tarihinden itibaren aktivasyonunu içeren uygulama emrinin Hv.K.K.lığı tarafından yayımlanmasından sonra HİLYOK K.lığı isim değiştirerek Hrk.Hzr.ve Ynt.Ok.K.lığı Sürekli Eğitim Modeli (SEM) kapsamında Hava Kuvvetlerine özgü Subay Özel Gelişim Eğitiminin de okulumuz bünyesine girmesiyle Ağustos 2006 tarihinden itibaren okulumuz Hrk.Hzr.ve Sb.Glş.Ok.K.lığı adı altında eğitim-öğretim faaliyetlerini sürdürmektedir.